Basado en el argumento del videojuego Silent Hill 3, la trama de la película seguirá a Heather Mason (Adelaide Clemens), una adolescente que, junto a su padre Christopher Da Silva (Sean Bean), han estado evadiendo a la fuerza de una naturaleza que no se reconoce completamente, y en vísperas de su decimoctavo cumpleaños, plagada de pesadillas y la desaparición de su padre, descubre que su supuesta identidad es falsa y los orígenes de su vida, también.
Como resultado de esta revelación, ella es atraída por la ciudad de Silent Hill, que es más un culto dirigido por una mujer y un hombre loco en el poder. Los líderes son Claudia Wolf (Carrie-Anne Moss) y Leonard Wolf (Malcolm McDowell). Heather es acompañada por un hombre llamado Vincent (Kit Harington), otro llamado Harry y Rose Da Silva (Radha Mitchell).
